RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445402.5

PQLC3-205, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene PQLC3, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-205ENST00000445402 SRGAP3O43295 1099 aa29■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 NBPF9Q3BBW0 867 aa29■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 COPRSQ9NQ92 184 aa29■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 MMP14P50281 582 aa28.99■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.99■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 VPS37DQ86XT2 251 aa28.99■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 SULF1Q8IWU6 871 aa28.99■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.99■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.98■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.98■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 WNT10BO00744 389 aa28.97■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 VEGFBP49765 207 aa28.97■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.97■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.97■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 F8W031 263 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 BCAMP50895 628 aa28.96■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 LPIN2Q92539 896 aa28.96■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.96■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.95■■■□□ 2.23
PQLC3-205ENST00000445402 SLC5A1P13866 664 aa28.95■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.95■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 ATP2B3Q16720 1220 aa28.94■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.94■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.93■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 PANK1Q8TE04 598 aa28.92■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 CDCA5Q96FF9 252 aa28.92■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.92■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 DLGAP5Q15398 846 aa28.91■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.91■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.91■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.9■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 CFAP100Q494V2 611 aa28.89■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.89■■■□□ 2.22
PQLC3-205ENST00000445402 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 PCNTO95613 3336 aa28.89■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 GRIK5Q16478 980 aa28.88■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 CAPNS2Q96L46 248 aa28.88■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 TFCP2Q12800 502 aa28.87■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 GRM1Q13255 1194 aa28.87■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.86■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 SPDYE6P0CI01 402 aa28.86■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.86■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.86■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.86■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 MS4A1P11836 297 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 ADORA1P30542 326 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 ECE1P42892 770 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 HUNKP57058 714 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 POLA2Q14181 598 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 AOX1Q06278 1338 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.85■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 ATP8B2P98198 1209 aa28.84■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.84■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 PHKA1P46020 1223 aa28.83■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 TIMM10P62072 90 aa28.83■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 SSH3Q8TE77 659 aa28.83■■■□□ 2.21
PQLC3-205ENST00000445402 CLRN2A0PK11 232 aa28.82■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.82■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 A0A1B0GUL7 405 aa28.81■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 MYO1BO43795 1136 aa28.81■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 CRKP46108 304 aa28.8■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 CCDC102BQ68D86 513 aa28.8■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.8■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 AOC2O75106 756 aa28.79■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.79■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 COG6Q9Y2V7 657 aa28.79■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.79■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 CEP85Q6P2H3 762 aa28.78■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 XAGE2Q96GT9 111 aa28.78■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 VEZTQ9HBM0 779 aa28.78■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.78■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 SEMA3EO15041 775 aa28.77■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 FKBP1BP68106 108 aa28.77■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 RGMBQ6NW40 437 aa28.77■■■□□ 2.2
PQLC3-205ENST00000445402 MOB2Q70IA6 237 aa28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms