RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	22.41	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP14	P50281	582 aa		22.41	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		22.41	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MXD3	Q9BW11	206 aa		22.41	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SNAP23	O00161	211 aa		22.4	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF5L	O75529	589 aa		22.4	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NF2	P35240	595 aa		22.4	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		22.4	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	22.4	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNJ4	P48050	445 aa		22.39	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	22.39	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	22.39	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CD209	Q9NNX6	404 aa		22.39	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR25	O00155	361 aa		22.38	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	22.38	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		22.38	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		22.38	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXW7	Q969H0	707 aa		22.38	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	22.36	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	SREBF2	Q12772	1141 aa		22.36	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		22.36	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		22.36	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	22.35	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	IL1R1	P14778	569 aa		22.35	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2I	P78347	998 aa		22.35	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	22.35	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		22.35	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	22.35	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		22.35	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	SASH1	O94885	1247 aa		22.34	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	22.34	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	22.34	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		22.34	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	USP44	Q9H0E7	712 aa		22.34	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	FKTN	O75072	461 aa		22.33	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		22.33	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	22.33	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	22.33	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		22.33	■■□□□ 1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKG1	Q13976	671 aa		22.32	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE4A	Q14139	1066 aa		22.32	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		22.32	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		22.32	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		22.32	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PLIN1	O60240	522 aa		22.31	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	22.31	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRYD7	Q5W111	196 aa		22.31	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CERS5	Q8N5B7	392 aa		22.31	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		22.31	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	22.3	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		22.29	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDH1A1	P00352	501 aa		22.29	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	INHBE	P58166	350 aa		22.29	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		22.29	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		22.28	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		22.28	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DLGAP5	Q15398	846 aa		22.27	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC24	Q50LG9	513 aa		22.27	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		22.27	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	22.27	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		22.27	■■□□□ 1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		22.26	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K11	Q16584	847 aa		22.26	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		22.26	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GYG1	P46976	350 aa		22.25	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FZD1	Q9UP38	647 aa		22.25	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNL1	Q8IU54	200 aa		22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		22.24	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	UNCX	A6NJT0	531 aa		22.23	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE8B	O95263	885 aa		22.23	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	22.23	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	22.23	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	JAG2	Q9Y219	1238 aa		22.23	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		22.22	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL24	Q5JXM2	366 aa		22.22	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		22.22	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	WNK4	Q96J92	1243 aa		22.22	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		22.22	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	22.21	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP100	Q494V2	611 aa		22.21	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		22.21	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	22.21	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM17	Q9Y577	477 aa		22.21	■■□□□ 1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		22.2	■■□□□ 1.14
MRPL28-203	ENST00000429738		F8W031	263 aa	Predicted RBP	22.2	■■□□□ 1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO1B	O43795	1136 aa		22.2	■■□□□ 1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SPDYE6	P0CI01	402 aa		22.2	■■□□□ 1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		22.2	■■□□□ 1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	22.2	■■□□□ 1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		22.2	■■□□□ 1.14

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