RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 NF2P35240 595 aa26.49■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 UBE4AQ14139 1066 aa26.49■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.48■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 CSRNP1Q96S65 589 aa26.48■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 SLFN5Q08AF3 891 aa26.47■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 RNF186Q9NXI6 227 aa26.47■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.46■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 DLGAP5Q15398 846 aa26.46■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.46■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.45■■□□□ 1.83
LIMS1-208ENST00000428064 MOB2Q70IA6 237 aa26.45■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.45■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.45■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.45■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.44■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 PLIN1O60240 522 aa26.44■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.44■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.44■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 TRPA1O75762 1119 aa26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE6P0CI01 402 aa26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.42■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 MYO1BO43795 1136 aa26.41■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP100Q494V2 611 aa26.41■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 LAMB1P07942 1786 aa26.41■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.39■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 F8W031 263 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 DGKZQ13574 1117 aa26.39■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K11Q16584 847 aa26.39■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.39■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 USP44Q9H0E7 712 aa26.39■■□□□ 1.82
LIMS1-208ENST00000428064 GYG1P46976 350 aa26.38■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.38■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 UNCXA6NJT0 531 aa26.37■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 TM4SF4P48230 202 aa26.37■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.37■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.37■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.37■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.36■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC24Q50LG9 513 aa26.36■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.36■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.36■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 JAG2Q9Y219 1238 aa26.36■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 KIF16BQ96L93 1317 aa26.36■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 PDE8BO95263 885 aa26.35■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 METTL24Q5JXM2 366 aa26.35■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 CCER2I3L3R5 266 aa26.34■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 RGS19P49795 217 aa26.34■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 SREBF2Q12772 1141 aa26.34■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.34■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 CLRN2A0PK11 232 aa26.33■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.33■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.33■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.33■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
LIMS1-208ENST00000428064 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 TNFAIP1Q13829 316 aa26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 PRKG1Q13976 671 aa26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 VPS37DQ86XT2 251 aa26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 VEZTQ9HBM0 779 aa26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 AOX1Q06278 1338 aa26.32■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 SPRYD7Q5W111 196 aa26.31■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 RASA3Q14644 834 aa26.3■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.3■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 FGFR2P21802 821 aa26.29■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 EYA2O00167 538 aa26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 CRKP46108 304 aa26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 INHBEP58166 350 aa26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO3Q9UK99 471 aa26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 FZD1Q9UP38 647 aa26.28■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 OTOFQ9HC10 1997 aa26.27■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.27■■□□□ 1.8
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