RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427506.5

GPC1-205, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPC1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-205ENST00000427506 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.05■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 PDE8BO95263 885 aa23.04■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 MAP2K2P36507 400 aa23.04■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 BCAR3O75815 825 aa23.03■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 DLGAP5Q15398 846 aa23.03■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.03■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 EYA2O00167 538 aa23.02■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 RGMBQ6NW40 437 aa23.02■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 MEIS3Q99687 375 aa23.02■■□□□ 1.28
GPC1-205ENST00000427506 PCNTO95613 3336 aa23.01■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.01■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.01■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.01■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 GNAI3P08754 354 aa23■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
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GPC1-205ENST00000427506 MFSD14BQ5SR56 506 aa23■■□□□ 1.27
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GPC1-205ENST00000427506 TNS4Q8IZW8 715 aa23■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 SIL1Q9H173 461 aa23■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 TRIM27P14373 513 aa22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 NF2P35240 595 aa22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 NOGQ13253 232 aa22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 CFAP100Q494V2 611 aa22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.98■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 MYO1BO43795 1136 aa22.98■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 LBX1P52954 281 aa22.98■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 FKBP1BP68106 108 aa22.98■■□□□ 1.27
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GPC1-205ENST00000427506 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.98■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 CCDC102AQ96A19 550 aa22.98■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.98■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 SLC5A1P13866 664 aa22.97■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.97■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 FBXO3Q9UK99 471 aa22.97■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 TNNQ9UQP3 1299 aa22.97■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.97■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 BCAMP50895 628 aa22.96■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.96■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.96■■□□□ 1.27
GPC1-205ENST00000427506 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.96■■□□□ 1.27
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GPC1-205ENST00000427506 CIAO1O76071 339 aa22.95■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 SPDYE6P0CI01 402 aa22.95■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 FGFR2P21802 821 aa22.95■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.95■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 LPIN2Q92539 896 aa22.95■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 CLRN2A0PK11 232 aa22.94■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 MOB2Q70IA6 237 aa22.94■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.94■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 VEZTQ9HBM0 779 aa22.94■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 ZIC5Q96T25 663 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.93■■□□□ 1.26
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GPC1-205ENST00000427506 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 SRGAP3O43295 1099 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 PRKG1Q13976 671 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 ATP2B3Q16720 1220 aa22.92■■□□□ 1.26
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GPC1-205ENST00000427506 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 CA12O43570 354 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 GNAI2P04899 355 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 SLC10A3P09131 477 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 TSKSQ9UJT2 592 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 CRKP46108 304 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GPC1-205ENST00000427506 GRIK5Q16478 980 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-205ENST00000427506 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-205ENST00000427506 MTX1Q13505 466 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-205ENST00000427506 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GPC1-205ENST00000427506 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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