RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SOGA3Q5TF21 947 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 MSL1Q68DK7 614 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 CERS3Q8IU89 383 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 FAM227BQ96M60 508 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 IL1R1P14778 569 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 GYG1P46976 350 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SCARF1Q14162 830 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 COA1Q9GZY4 146 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 MED23Q9ULK4 1368 aa11.51□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0D9SFI3 127 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf229H3BNL8 230 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 UFL1O94874 794 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 LDHCP07864 332 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 GSTO1P78417 241 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SLF2Q8IX21 1173 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 TTLL6Q8N841 843 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 KIF2CQ99661 725 aa11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SNAP23O00161 211 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 PDE6AP16499 860 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 ALX1Q15699 326 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 HSCBQ8IWL3 235 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 CD209Q9NNX6 404 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 DOCK2Q92608 1830 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 G3V3G9 751 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 PTH1RQ03431 593 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 PODNQ7Z5L7 613 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 OSBP2Q969R2 916 aa11.48□□□□□ -0.57
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HDLBP-211ENST00000425989 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.48□□□□□ -0.57
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HDLBP-211ENST00000425989 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 NT5C2P49902 561 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
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HDLBP-211ENST00000425989 CREB3L3Q68CJ9 461 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
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HDLBP-211ENST00000425989 PIM2Q9P1W9 311 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.46□□□□□ -0.57
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HDLBP-211ENST00000425989 ZMYM6O95789 1325 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 SLC27A2O14975 620 aa11.46□□□□□ -0.57
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HDLBP-211ENST00000425989 NEK4P51957 841 aa11.46□□□□□ -0.57
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HDLBP-211ENST00000425989 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 IL25Q9H293 177 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-211ENST00000425989 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
HDLBP-211ENST00000425989 COL4A1P02462 1669 aa11.46□□□□□ -0.58
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF213O14771 459 aa11.45□□□□□ -0.58
HDLBP-211ENST00000425989 BAG3O95817 575 aa11.45□□□□□ -0.58
HDLBP-211ENST00000425989 MMP14P50281 582 aa11.45□□□□□ -0.58
HDLBP-211ENST00000425989 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
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