RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 METTL24Q5JXM2 366 aa16.76■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.76■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCNTO95613 3336 aa16.76■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SASH1O94885 1247 aa16.75■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NOGQ13253 232 aa16.75■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC24Q50LG9 513 aa16.75■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RGMBQ6NW40 437 aa16.75■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CERS5Q8N5B7 392 aa16.75■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.75■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF16BQ96L93 1317 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GYG1P46976 350 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LBX1P52954 281 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FKBP1BP68106 108 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DLGAP5Q15398 846 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC102AQ96A19 550 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.74■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDE8BO95263 885 aa16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VPS37DQ86XT2 251 aa16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.72■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 F8W031 263 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.72■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JAG2Q9Y219 1238 aa16.72■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A0A1B0GUL6 1792 aa16.72■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CA12O43570 354 aa16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NF2P35240 595 aa16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.71■□□□□ 0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EYA2O00167 538 aa16.7■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYO1BO43795 1136 aa16.7■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFAP100Q494V2 611 aa16.7■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.7■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC10A3P09131 477 aa16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZIC5Q96T25 663 aa16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GNAI3P08754 354 aa16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPDYE6P0CI01 402 aa16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MEIS3Q99687 375 aa16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FBXO3Q9UK99 471 aa16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.68■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC5A1P13866 664 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FGFR2P21802 821 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BCAMP50895 628 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MOB2Q70IA6 237 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LPIN2Q92539 896 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSKSQ9UJT2 592 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.67■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CLRN2A0PK11 232 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BCAR3O75815 825 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CIAO1O76071 339 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM27P14373 513 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SIL1Q9H173 461 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VEZTQ9HBM0 779 aa16.65■□□□□ 0.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPN15O75808 1086 aa16.64■□□□□ 0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms