RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EVI5LQ96CN4 794 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATG3Q9NT62 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FDX1P10109 184 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPR108Q9NPR9 543 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COPRSQ9NQ92 184 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.49□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAN1A2O60476 641 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MBD3O95983 291 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF445P59923 1031 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GCKRQ14397 625 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.48□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPTLC1O15269 473 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CYP27B1O15528 508 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCNQ3O43525 872 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BRD1O95696 1058 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGKV5-2P06315 115 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEK4P51957 841 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VPS53Q5VIR6 699 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MPNDQ8N594 471 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BAP1Q92560 729 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMX3Q96JJ7 454 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTC14Q96N46 770 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM117AQ9C073 453 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.47□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 JCADQ9P266 1359 aa6.46□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MEGF6O75095 1541 aa6.46□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP5JP18859 108 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NDUFV2P19404 249 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PSMA5P28066 241 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IRS1P35568 1242 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRT32Q14532 448 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD1Q15327 319 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HS1BP3Q53T59 392 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNS2Q63HR2 1409 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BRINP3Q76B58 766 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RETREG3Q86VR2 466 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RGS22Q8NE09 1264 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP4K1Q92918 833 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RILPL2Q969X0 211 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KAZALD1Q96I82 304 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.46□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms