RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.41■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.4■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.4■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.4■□□□□ 0.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXW7Q969H0 707 aa20.39■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.39■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 AOX1Q06278 1338 aa20.38■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB22O15209 634 aa20.38■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.38■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.38■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 JAG2Q9Y219 1238 aa20.38■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.38■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRIK5Q16478 980 aa20.37■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 OGFOD1Q8N543 542 aa20.37■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIL1Q9H173 461 aa20.37■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNAI2P04899 355 aa20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCAMP50895 628 aa20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 LPIN2Q92539 896 aa20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRGAP3O43295 1099 aa20.35■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.35■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 SULF1Q8IWU6 871 aa20.35■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDCA5Q96FF9 252 aa20.35■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLA2Q14181 598 aa20.34■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPDYE6P0CI01 402 aa20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP2B3Q16720 1220 aa20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.33■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAMB1P07942 1786 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC5A1P13866 664 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 SSH3Q8TE77 659 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAPNS2Q96L46 248 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFAP100Q494V2 611 aa20.31■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 PANK1Q8TE04 598 aa20.31■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.31■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 F8W031 263 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADORA1P30542 326 aa20.3■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 WBP1LQ9NX94 342 aa20.3■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.3■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 OTOFQ9HC10 1997 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP8B2P98198 1209 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 DLGAP5Q15398 846 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHKA1P46020 1223 aa20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 HUNKP57058 714 aa20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 TFCP2Q12800 502 aa20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 VPS37DQ86XT2 251 aa20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 ECE1P42892 770 aa20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 FKBP1BP68106 108 aa20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRIQ9BWK5 157 aa20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.27■□□□□ 0.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.27■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A1B0GUL7 405 aa20.26■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 AOC2O75106 756 aa20.26■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 TIMM10P62072 90 aa20.26■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.26■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZIC5Q96T25 663 aa20.26■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 SEMA3EO15041 775 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 FOXN1O15353 648 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP2K2P36507 400 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 CRKP46108 304 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC102BQ68D86 513 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms