RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 TRPA1O75762 1119 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 LCE4AQ5TA78 99 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 ASIC4Q96FT7 647 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 FBXL18Q96ME1 805 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 RXRBP28702 533 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 STIM2Q9P246 746 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 DLGAP3O95886 979 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 STK32AQ8WU08 396 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 ADMP35318 185 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 NFKBIBQ15653 356 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-202ENST00000367364 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 ABTB2Q8N961 1025 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 CYP26A1O43174 497 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 DRD2P14416 443 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 ARL4DP49703 201 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 PAOXQ6QHF9 649 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATCAYQ86WG3 371 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 GATA6Q92908 595 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 CES1P23141 567 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZAR1Q86SH2 424 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 USP26Q9BXU7 913 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 CHRDQ9H2X0 955 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 XKR5Q6UX68 686 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 FLCNQ8NFG4 579 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 FAM170BA6NMN3 283 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 PAPLNO95428 1278 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 NXPE3Q969Y0 559 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 IKBKEQ14164 716 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 BSNDQ8WZ55 320 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-202ENST00000367364 A6NHS1 94 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 USP11P51784 963 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 OSMRQ99650 979 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 EDEM1Q92611 657 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 SLAIN2Q9P270 581 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 SEPT3Q9UH03 358 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 PDGFAP04085 211 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 ADH5P11766 374 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF124Q15973 351 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 PMEPA1Q969W9 287 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 EREGO14944 169 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms