RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 TRPA1O75762 1119 aa28.66■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 DLGAP5Q15398 846 aa28.66■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 PTPRCP08575 1304 aa28.66■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.65■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.65■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 F8W031 263 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.64■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CLTB-202ENST00000345807 JAG2Q9Y219 1238 aa28.64■■■□□ 2.18
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CLTB-202ENST00000345807 UBE4AQ14139 1066 aa28.63■■■□□ 2.17
CLTB-202ENST00000345807 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.63■■■□□ 2.17
CLTB-202ENST00000345807 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
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CLTB-202ENST00000345807 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.61■■■□□ 2.17
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CLTB-202ENST00000345807 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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CLTB-202ENST00000345807 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.6■■■□□ 2.17
CLTB-202ENST00000345807 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.6■■■□□ 2.17
CLTB-202ENST00000345807 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.6■■■□□ 2.17
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CLTB-202ENST00000345807 MYO1BO43795 1136 aa28.58■■■□□ 2.17
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CLTB-202ENST00000345807 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
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CLTB-202ENST00000345807 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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CLTB-202ENST00000345807 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
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CLTB-202ENST00000345807 AOX1Q06278 1338 aa28.53■■■□□ 2.16
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CLTB-202ENST00000345807 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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CLTB-202ENST00000345807 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.48■■■□□ 2.15
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CLTB-202ENST00000345807 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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CLTB-202ENST00000345807 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CLTB-202ENST00000345807 GRIK5Q16478 980 aa28.44■■■□□ 2.14
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CLTB-202ENST00000345807 CCER2I3L3R5 266 aa28.43■■■□□ 2.14
CLTB-202ENST00000345807 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CLTB-202ENST00000345807 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CLTB-202ENST00000345807 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CLTB-202ENST00000345807 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
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