RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 CYR61O00622 381 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0A6YYD5 115 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 F11P03951 625 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MAS1LP35410 378 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 CEACAM6P40199 344 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ASIPP42127 132 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 UCNP55089 124 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 COX20Q5RI15 118 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 AESQ08117 197 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 NUDT11Q96G61 164 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 LRP12Q9Y561 859 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 EFSO43281 561 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 HPRT1P00492 218 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF735P0CB33 412 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 OPRM1P35372 400 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 ERVFRD-1P60508 538 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 PMP22Q01453 160 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 R3HDM4Q96D70 268 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TREM2Q9NZC2 230 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 NEU3Q9UQ49 428 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.65□□□□□ -1.5
SCN2A-209ENST00000636071 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 BHLHE23Q8NDY6 225 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 RELTQ969Z4 430 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 LMO7DNF2Z398 122 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ATP5LO75964 103 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 IL4P05112 153 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 MLF1P58340 268 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF117Q03924 483 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 FMODQ06828 376 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM215Q68D42 235 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 C17orf99Q6UX52 265 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 WDR31Q8NA23 367 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 DTD1Q8TEA8 209 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 GGACTQ9BVM4 153 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 NAGKQ9UJ70 344 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 HMX2A2RU54 273 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 FCARP24071 287 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R1AQ13522 171 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.65□□□□□ -1.51
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SCN2A-209ENST00000636071 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ZBP1Q9H171 429 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.65□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PR48 441 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 HPXP02790 462 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 AMY1AP04745 511 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 FAM78AQ5JUQ0 283 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 KIR2DL4Q99706 377 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GTH9 108 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00587B1AMM8 73 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 LYPD8Q6UX82 237 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 OR4C3Q8NH37 302 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 GPR35Q9HC97 309 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 OR51B4Q9Y5P0 310 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0B4J293 547 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 A6NL46 340 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 J3QT63 122 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 FAHP16930 419 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 SHISA5Q8N114 240 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 OPN4Q9UHM6 478 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF98A6NK75 572 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 M0R1B8 84 aa5.64□□□□□ -1.51
SCN2A-209ENST00000636071 F2RL2O00254 374 aa5.64□□□□□ -1.51
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