RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 TMEM106AQ96A25 262 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 TCF19Q9Y242 345 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 A0A0G2JK05 382 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 ODAMA1E959 279 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 M0QZ24 198 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 ARG1P05089 322 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 COX7A1P24310 79 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 PPP3R1P63098 170 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 EDDM3AQ14507 147 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 Q499Y3 187 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 BRICD5Q6PL45 260 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 BATF2Q8N1L9 274 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 ZNF596Q8TC21 504 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 NOTCH1P46531 2555 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PRD5 423 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PRF3 423 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PRM7 423 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 OOSP1A8MZH6 123 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 H3BUI4 141 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 SIRPB1O00241 398 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 GABRPO00591 440 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 DEGS1O15121 323 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 CLIC3O95833 236 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 IGLV1-47P01700 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 TMEM225BP0DP42 221 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 ZNF44P15621 663 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 HTR1DP28221 377 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 BDKRB2P30411 391 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 PTGFRP43088 359 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKP4-218ENST00000629219 EFNB2P52799 333 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKP4-218ENST00000629219 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 XAF1Q6GPH4 301 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 TREML4Q6UXN2 200 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 C17orf50Q8WW18 174 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 TFAP2CQ92754 450 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 GGHQ92820 318 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 GHSRQ92847 366 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 RFT1Q96AA3 541 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 COQ2Q96H96 371 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 SPACA5Q96QH8 159 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 CHST6Q9GZX3 395 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 MMP27Q9H306 513 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 CKLFQ9UBR5 152 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKP4-218ENST00000629219 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.32□□□□□ -1.24
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PKP4-218ENST00000629219 A6NDX4 124 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 LALBAP00709 142 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-218ENST00000629219 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.32□□□□□ -1.24
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