RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTT2BP0CG30 244 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM225BP0DP42 221 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 AP3S2P59780 193 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF154Q13106 437 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2T2Q6IF00 324 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10K2Q6IF99 312 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DTX3Q8N9I9 347 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR56B1Q8NGI3 324 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 NPRL2Q8WTW4 380 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 NPTNQ9Y639 398 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GWJ7 208 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS3P35030 304 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PSG7Q13046 419 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM104Q8NE00 496 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 HPSE2Q8WWQ2 592 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOFQ9HBH0 211 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MSL2Q9HCI7 577 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 INSIG2Q9Y5U4 225 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 F5H0A9 414 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ORC5O43913 435 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM4BO94953 1096 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GCH1P30793 250 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GNG3P63215 75 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DGCR2P98153 550 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF573Q86YE8 665 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10R2Q8NGX6 335 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP3Q92482 292 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK15Q9H427 330 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MTFP1Q9UDX5 166 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 AUP1Q9Y679 476 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MXK9 166 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN34H7C241 214 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 LANCL1O43813 399 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MPIG6BO95866 241 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2F2P13984 249 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS12P56730 875 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MADCAM1Q13477 382 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF260Q3ZCT1 412 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A6Q4U2R8 563 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SPERTQ8NA61 448 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP18Q8NEJ0 188 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8G5Q8NG78 346 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52I2Q8NH67 350 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GPX8Q8TED1 209 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 EGLN1Q9GZT9 426 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PLSCR5A0PG75 271 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CA11O75493 328 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RBBP9O75884 186 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MGMTP16455 207 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CPT2P23786 658 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RFX2P48378 723 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PAX2Q02962 417 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 BAMBIQ13145 260 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A3R2Q15599 337 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ELP2Q6IA86 826 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MKXQ8IYA7 352 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF170Q96K19 258 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MICU1Q9BPX6 476 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PKIBQ9C010 78 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 WNK1Q9H4A3 2382 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPXA8MT69 81 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 LYRM1O43325 122 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CSTBP04080 98 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CD3GP09693 182 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MPZP25189 248 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 GDNFP39905 211 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 IL13RA1P78552 427 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RSU1Q15404 277 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM155Q4W5P6 130 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZR03 302 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5D18Q8NGL1 313 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RTL8AQ9BWD3 113 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM106BQ9NUM4 274 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM100Q9NV29 134 aa20.03■□□□□ 0.8
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