RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CRLF2Q9HC73 371 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TYMSP04818 313 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ASCL1P50553 236 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RNF4P78317 190 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GAGE1Q13065 139 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NABP1Q96AH0 204 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 WASF3Q9UPY6 502 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SHISA7A6NL88 538 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 DFFBO76075 338 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RRADP55042 308 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TFF2Q03403 129 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZNF726P1Q15940 193 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM54Q969K7 222 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TOMM40LQ969M1 308 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WZY1 265 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM210A6NLX4 147 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-34P06331 123 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A6P12236 298 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 FAHP16930 419 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 APLNRP35414 380 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MYBPHQ13203 477 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM42Q69YG0 159 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 YAF2Q8IY57 180 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PGAM5Q96HS1 289 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 LAMA3Q16787 3333 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MARCH11A6NNE9 402 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 AADACP22760 399 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PTGDSP41222 190 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TDGF1P3P51864 188 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 DCAF10Q5QP82 559 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PPP5D1E7EU14 171 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CCKARP32238 428 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OXGR1Q96P68 337 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 USP34Q70CQ2 3546 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SSSCA1O60232 199 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ONECUT2O95948 504 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PPYP01298 95 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GNRHRP30968 328 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 FBXW4P57775 412 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RUNX1Q01196 453 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 Q8NFD4 153 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 LRRC61Q9BV99 259 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 AQP7P3A6NL99 342 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 B4E171 279 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GZMHP20718 246 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MSX1P28360 303 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TSPAN7P41732 249 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CCR5P51681 352 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SSX7Q7RTT5 188 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PIGTQ969N2 578 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NAT8Q9UHE5 227 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IGLV3-19P01714 112 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CASP6P55212 293 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms