RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	EXTL1	Q92935	676 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR10C1	Q96KK4	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TAAR6	Q96RI8	345 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ARV1	Q9H2C2	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CDH20	Q9HBT6	801 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GLRX2	Q9NS18	164 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PPE2	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	COLCA2	A8K830	154 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		M0R143	59 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HRK	O00198	91 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RER1	O15258	196 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MPZL1	O95297	269 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PPY	P01298	95 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FCGR3A	P08637	254 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PGA4	P0DJD7	388 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SLC25A6	P12236	298 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ATP6V0C	P27449	155 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IL2RG	P31785	369 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	AKR1C3	P42330	323 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	VEGFB	P49765	207 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RND3	P61587	244 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	UNC119	Q13432	240 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IGFBP7	Q16270	282 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SYT13	Q7L8C5	426 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	REC114	Q7Z4M0	266 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF383	Q8NA42	475 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NAXE	Q8NCW5	288 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CRLF2	Q9HC73	371 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LANCL2	Q9NS86	450 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IL36G	Q9NZH8	169 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RELN	P78509	3460 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C20orf202	A1L168	122 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		H0Y980	276 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MS4A18	H0YCH9	400 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HSD17B6	O14756	317 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ADAM20	O43506	726 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PDE6D	O43924	150 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ARG1	P05089	322 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINA7	P05543	415 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BCL2	P10415	239 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PNLIP	P16233	465 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	KITLG	P21583	273 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CTSS	P25774	331 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GALR1	P47211	349 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GFER	P55789	205 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM187	Q14656	261 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C10orf128	Q5T292	105 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BIVM	Q86UB2	503 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM123	Q8N131	208 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ISOC2	Q96AB3	205 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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