RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 UBTD1Q9HAC8 227 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM106BQ9NUM4 274 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RFX2P48378 723 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 BRICD5Q6PL45 260 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 NRARPQ7Z6K4 114 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ETAA1Q9NY74 926 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf80F5H4A9 247 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM178BH3BS89 294 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRPB1O00241 398 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDX2P32119 198 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MEF2DQ14814 521 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP18Q8NEJ0 188 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 COPZ2Q9P299 210 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 OOEPA6NGQ2 149 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 VGLL3A8MV65 326 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 NAPSAO96009 420 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HPXP02790 462 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CD3DP04234 171 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FCGR3AP08637 254 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A1P30531 599 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf204Q6ZNR8 217 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 BEST4Q8NFU0 473 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R35Q8TAP8 253 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB3DO95716 219 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN1O95832 211 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 COX6B1P14854 86 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R46P59540 309 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZS49 121 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C16Q8NGL9 310 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPTL6Q8NI99 470 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNG6Q9BXT2 260 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 DLL4Q9NR61 685 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMP3Q9UQV4 416 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS8O00214 317 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 FSTL3O95633 263 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CD80P33681 288 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 GAPTQ8N292 157 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL17Q92583 94 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAPC3Q92966 411 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DNTTIP1Q9H147 329 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DPAGT1Q9H3H5 408 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM165Q9HC07 324 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF222Q9UK12 451 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIAL4EA0A075B759 164 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIAL4DF5H284 164 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CSN2P05814 226 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIAL4FP0DN26 164 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 AMY2BP19961 511 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DMAP28067 261 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 BTCP35070 178 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX5Q02548 391 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 COL10A1Q03692 680 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 STUMQ69YW2 141 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 BPIFB2Q8N4F0 458 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CD177Q8N6Q3 437 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4S1Q8NGB4 309 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4K15Q8NH41 348 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CYYR1Q96J86 154 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIAL4AQ9Y536 164 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPB6O14558 160 aa25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZNX1 250 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF561Q8N587 486 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DYRK2Q92630 601 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX22Q96L94 193 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-206ENST00000588815 PSPNO60542 156 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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CAPNS1-206ENST00000588815 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52W1Q6IF63 320 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5T2Q8NGG2 359 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SDSLQ96GA7 329 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPA2Q9H2U2 334 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MCUBQ9NWR8 336 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DSCAML1Q8TD84 2053 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ8Q15842 424 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA1AQ53H76 456 aa25.98■■□□□ 1.75
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