RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580861.1

LINC00511-210, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 4

Gene LINC00511, Length 467 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 OR56B4Q8NH76 319 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 BORCS8Q96FH0 119 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF488Q96MN9 340 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 SPACA5Q96QH8 159 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 CTSZQ9UBR2 303 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF222Q9UK12 451 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 A8MXK9 166 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 KDM4BO94953 1096 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 TCRBP04435 133 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 IRF2P14316 349 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 PRSS3P35030 304 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 NPBWR2P48146 333 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ATP1B3P54709 279 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 CLDN12P56749 244 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 PAX2Q02962 417 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 SPICQ8N5J4 248 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 Q8NFD4 153 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 UPRTQ96BW1 309 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 GAL3ST1Q99999 423 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 RASL12Q9NYN1 266 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 RAB22AQ9UL26 194 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 ALG5Q9Y673 324 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00511-210ENST00000580861 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 A0A1B0GW55 424 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 LANCL1O43813 399 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 ANGPTL7O43827 346 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 CD5LO43866 347 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 LY6G6DO95868 133 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 GYPAP02724 150 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 TFF1P04155 84 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 SFTPBP07988 381 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 PSG2P11465 335 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 GLRA1P23415 457 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 GZMKP49863 264 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 CBX3Q13185 183 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 MICBQ29980 383 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 BIVMQ86UB2 503 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 PXT1Q8NFP0 134 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 OR52I2Q8NH67 350 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 FAM46BQ96A09 425 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 SLAMF9Q96A28 289 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00511-210ENST00000580861 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms