RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CXCR4P61073 352 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 PAX8Q06710 450 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 SLC3A1Q07837 685 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 PRDX4Q13162 271 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 TAF13Q15543 124 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR8G1Q15617 311 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LIPNQ5VXI9 398 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LPCAT4Q643R3 524 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 GID4Q8IVV7 300 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 SPERTQ8NA61 448 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR51F2Q8NH61 342 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 SLC22A4Q9H015 551 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CSTL1Q9H114 145 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR51I2Q9H344 312 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF222Q9UK12 451 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 A0A1B0GUV1 79 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 METTL15A6NJ78 407 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 PRAC2D3DTV9 90 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 F8VVB4 439 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 F8VWA3 439 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 J3QLI3 93 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 J3QR06 171 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LGALS8O00214 317 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 P2RY10O00398 339 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CDIPTO14735 213 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 RHBDL1O75783 438 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 SULT1C4O75897 302 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 DHRS3O75911 302 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CLIC3O95833 236 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 GNAO1P09471 354 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR2T7P0C7T2 308 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LIMS3P0CW19 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LIMS4P0CW20 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ATP6V1B1P15313 513 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ADRA2CP18825 462 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CPT2P23786 658 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 MPZP25189 248 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 HSD11B1P28845 292 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 TGM4P49221 684 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR12D2P58182 307 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ERVK11-1P61568 191 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 LCN2P80188 198 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 RCN1Q15293 331 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 TP53I3Q53FA7 332 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 WDR38Q5JTN6 314 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF691Q5VV52 312 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 STUMQ69YW2 141 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 KRT77Q7Z794 578 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 RDH10Q8IZV5 341 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 SPICQ8N5J4 248 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 OR2T27Q8NH04 317 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 AQP3Q92482 292 aa3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PRPF8-211ENST00000574728 ITFG2Q969R8 447 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms