RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556980.5

XRCC3-217, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 801 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-217ENST00000556980 PTGFRP43088 359 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ELP2Q6IA86 826 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 Q6P435 159 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ORAI1Q96D31 301 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 AJUBAQ96IF1 538 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 OR14A2Q96R54 314 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 SSX3Q99909 188 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 VCX3BQ9H321 246 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ING3Q9NXR8 418 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.61□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 PTGES3LE9PB15 166 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 HSPB6O14558 160 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 CSN2P05814 226 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 CELP19835 753 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 GLIPR1P48060 266 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 AESQ08117 197 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 MYDGFQ969H8 173 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 S100A13Q99584 98 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 METTL9Q9H1A3 318 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 SCN3BQ9NY72 215 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ING4Q9UNL4 249 aa14.6□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ODAMA1E959 279 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ODF3BA8MYP8 253 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 H0YHG0 523 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 CDRT1O95170 752 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 HTR3BO95264 441 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 CDK1P06493 297 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 FSTP19883 344 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 IL13RA2Q14627 380 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 AANATQ16613 207 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 PIGYQ3MUY2 71 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ASCL4Q6XD76 172 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 MND1Q9BWT6 205 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
XRCC3-217ENST00000556980 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 A0A1W2PPK0 400 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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XRCC3-217ENST00000556980 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 ZNF626Q68DY1 528 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 THRSPQ92748 146 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 COQ2Q96H96 371 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 SLITRK2Q9H156 845 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 IL36GQ9NZH8 169 aa14.58□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 GPX5O75715 221 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 CD1AP06126 327 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 BDH1Q02338 343 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 LY6EQ16553 131 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 PLA1AQ53H76 456 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 RNLSQ5VYX0 342 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 OR52W1Q6IF63 320 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 OSR2Q8N2R0 312 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 Q8NFD4 153 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 CORO2AQ92828 525 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 MALSU1Q96EH3 234 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 DERL3Q96Q80 235 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.57□□□□□ -0.08
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XRCC3-217ENST00000556980 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 RNF114Q9Y508 228 aa14.57□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.56□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.56□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 MMP23AO75900 390 aa14.56□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 SERPINA2P20848 420 aa14.56□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 CDK2P24941 298 aa14.56□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
XRCC3-217ENST00000556980 DOC2BQ14184 412 aa14.56□□□□□ -0.08
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