RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM50B	P56557	158 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GMFB	P60983	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TSPAN5	P62079	268 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF154	Q13106	437 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		Q8NFD4	153 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PRRT1	Q99946	306 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0A6YYD4	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	HS3ST1	O14792	307 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PRAF2	O60831	178 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RHBDL1	O75783	438 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KNG1	P01042	644 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TCRB	P04435	133 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RLN1	P04808	185 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CSN2	P05814	226 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FCER2	P06734	321 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DTYMK	P23919	212 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DUSP1	P28562	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SLC6A1	P30531	599 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GLP1R	P43220	463 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RFX2	P48378	723 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	EFNB3	Q15768	340 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		Q6ZR03	302 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MMP28	Q9H239	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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