RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	MMP27	Q9H306	513 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PSPN	O60542	156 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF737	O75373	536 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FOXH1	O75593	365 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CSN2	P05814	226 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	GLA	P06280	429 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	OR3A1	P47881	315 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	EDDM3B	P56851	147 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	LMO4	P61968	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PLA2G7	Q13093	441 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	EDDM3A	Q14507	147 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		Q6ZTK2	550 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PDZD2	O15018	2839 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A0A6YYD4	124 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1B0GW55	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PPH5	198 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		H7C1Q1	480 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SOCS1	O15524	211 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CA11	O75493	328 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SELL	P14151	372 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	AMY2B	P19961	511 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CHAT	P28329	748 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	MNDA	P41218	407 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DUX4	Q9UBX2	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PQ09	198 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	SERPINE3	A8MV23	424 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904		B4DSR2	109 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB27B	O00194	218 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	CTDSP2	O14595	271 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	XRCC3	O43542	346 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	CLPX	O76031	633 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	ELK1	P19419	428 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	CDK2	P24941	298 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	IL2RG	P31785	369 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	GZMK	P49863	264 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	P2RX3	P56373	397 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	LCN2	P80188	198 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	PECR	Q9BY49	303 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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