RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MPV17LQ2QL34 196 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C22orf42Q6IC83 251 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBX15Q96SF7 602 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUP50Q9UKX7 468 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SSR3Q9UNL2 185 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV40A0A0B4J280 105 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FUOMA2VDF0 154 aa10.6□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A18PA6NE21 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A16PA6NEW6 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa10.6□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A22PA8MWA6 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A12PA8MX19 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa10.6□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 BPNT1O95861 308 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A15PP0C7V4 464 aa10.6□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A14PP0C7W9 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A24PP0C7X0 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MGMTP16455 207 aa10.6□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EPHA1P21709 976 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNJ3P48549 501 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 P2RX3P56373 397 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EDDM3BP56851 147 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BLMHQ13867 455 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EDDM3AQ14507 147 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM104Q8NE00 496 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPA2Q9H2U2 334 aa10.6□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.6□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFPP27918 469 aa10.59□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BPIFB3P59826 476 aa10.59□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q8N7P7 452 aa10.59□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.59□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR51E2Q9H255 320 aa10.59□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BANF2Q9H503 90 aa10.59□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.59□□□□□ -0.71
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PPE2 198 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PR64 198 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PRV1 198 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H3BUI4 141 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSPB6O14558 160 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBP4P02753 201 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VSIG8P0DPA2 414 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARSBP15848 533 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAB3BP20337 219 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GADD45AP24522 165 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 QRFPP83859 136 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAF9Q16594 264 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCR3LG1Q68D85 454 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.58□□□□□ -0.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TCF23Q7RTU1 214 aa10.58□□□□□ -0.72
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.58□□□□□ -0.72
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 YIPF6Q96EC8 236 aa10.58□□□□□ -0.72
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