RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 PLXNB1O43157 2135 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 TMEM212A6NML5 194 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 SULT1B1O43704 296 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 FBXO24O75426 580 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 IGLV1-47P01700 117 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CDK2P24941 298 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 BDH1Q02338 343 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 IL18R1Q13478 541 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CHST4Q8NCG5 386 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 APH1BQ8WW43 257 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 S100A14Q9HCY8 104 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 DPM3Q9P2X0 92 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ODAMA1E959 279 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 DEGS1O15121 323 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 HCKP08631 526 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CCDC159P0C7I6 412 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 TMEM225BP0DP42 221 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CD34P28906 385 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 MTNR1BP49286 362 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ZNF691Q5VV52 312 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ZNF596Q8TC21 504 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ZNF286AQ9HBT8 521 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ING3Q9NXR8 418 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 DHDHQ9UQ10 334 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 A0A087X0M5 115 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 A0A1B0GX30 115 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 FAM172BPA6NC97 362 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 LY6LH3BQJ8 138 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 LIMS3P0CW19 117 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 LIMS4P0CW20 117 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CGB3P0DN86 165 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CGB7P0DN87 165 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 CD24P25063 80 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 PTGFRP43088 359 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 KLHL22Q53GT1 634 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 UTF1Q5T230 341 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ELP2Q6IA86 826 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ZNF529Q6P280 563 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 PXT1Q8NFP0 134 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 STMN2Q93045 179 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 OR5M11Q96RB7 305 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 MMP28Q9H239 520 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 NOTCH1P46531 2555 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-229ENST00000551936 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 LEUTXA8MZ59 168 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 H0YJX3 145 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 H3BUI4 141 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 GABRPO00591 440 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 BRS3P32247 399 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 FBLN7Q53RD9 439 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 LPCAT4Q643R3 524 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 Q8NFD4 153 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 JAM3Q9BX67 310 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 OR6C3Q9NZP0 311 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 TGP01266 2768 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-229ENST00000551936 TOR1AO14656 332 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms