RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE12JA6NER3 117 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN2O60636 221 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE7O76087 117 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TRGC2P03986 189 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE12FP0CL80 117 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE12GP0CL81 117 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE12IP0CL82 117 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS3P35030 304 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 EVX1P49640 407 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DRB3P79483 266 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE4Q13068 117 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF695Q8IW36 515 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OXGR1Q96P68 337 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF727A8MUV8 499 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 M0QZ24 198 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-19P01714 112 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HKR1P10072 659 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SAP25Q8TEE9 199 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PTH2Q96A98 100 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR2V2Q96R30 315 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PRR14Q9BWN1 585 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MED20Q9H944 212 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LOC285556D6RIA3 1793 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A7O60669 478 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPINK8P0C7L1 97 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPINK2P20155 84 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DRD3P35462 400 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ECI1P42126 302 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ERVS71-1P61550 626 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GSG1Q2KHT4 349 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PNKDQ8N490 385 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PIGTQ969N2 578 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NEURL3Q96EH8 262 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 UCN2Q96RP3 112 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf71A4D174 169 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 J3KT08 172 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C1QTNF9P0C862 333 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM225BP0DP42 221 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MTNR1AP48039 350 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF345Q14585 488 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR1Q1Q15612 314 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR8B8Q15620 311 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MRGPREQ86SM8 312 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR2M3Q8NG83 312 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR1L3Q8NH93 324 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GPR78Q96P69 363 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPIN2AQ99865 258 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MMP25Q9NPA2 562 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf66A4D0T2 115 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 H3BQ15 152 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LMX1BO60663 402 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CA11O75493 328 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF13O75888 250 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TRGC1P0CF51 173 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms