RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 NFYBP25208 207 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 THBS3P49746 956 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 FAM220AQ7Z4H9 259 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 FGGYQ96C11 551 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 GNG8Q9UK08 70 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 ODAMA1E959 279 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 NUDT19A8MXV4 375 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 OOSP1A8MZH6 123 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 LMO1P25800 156 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 HTR1FP30939 366 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 KIR3DL2P43630 455 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 TP53I3Q53FA7 332 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 KRBOX4Q5JUW0 171 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 TMEM244Q5VVB8 128 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 RPEQ96AT9 228 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 OPALINQ96PE5 141 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 POMPQ9Y244 141 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 TENM3Q9P273 2699 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 A0A087X0M5 115 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GX30 115 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 G3V2T6 193 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 GYG2O15488 501 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 IGKV1D-12P01611 117 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 MYCNOSP40205 109 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 HES1Q14469 280 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 UTF1Q5T230 341 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 C18orf65Q6ZTR6 163 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 UTS2BQ765I0 119 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 OR2W3Q7Z3T1 314 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 RNF144BQ7Z419 303 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 OR9G1Q8NH87 305 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 CHPT1Q8WUD6 406 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 TOMM40LQ969M1 308 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 SPSB1Q96BD6 273 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 SPACA5Q96QH8 159 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 COMMD4Q9H0A8 199 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 NEK6Q9HC98 313 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-214ENST00000548849 FAM90A18PA6NE21 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A16PA6NEW6 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 SERPINE3A8MV23 424 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A12PA8MX19 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 KDM4BO94953 1096 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A15PP0C7V4 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A13PP0C7W8 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A14PP0C7W9 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 FAM90A24PP0C7X0 464 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 BNIP1Q12981 228 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 C17orf58Q2M2W7 97 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 DNAL1Q4LDG9 190 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 OR56B4Q8NH76 319 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 COQ2Q96H96 371 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 ZFP57Q9NU63 452 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 OR6C3Q9NZP0 311 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 LINC00527Q9UJ94 153 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 DEGS1O15121 323 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 IGHV3-7P01780 117 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 CSN2P05814 226 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 TMEM11P17152 192 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 DGCR2P98153 550 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 ZNF85Q03923 595 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 HNF4GQ14541 408 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 Q6P435 159 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 CHST4Q8NCG5 386 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 OR2G2Q8NGZ5 317 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 TFAP2CQ92754 450 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 HRASLS5Q96KN8 279 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 ENOPH1Q9UHY7 261 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 J3QR06 171 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 SLC6A1P30531 599 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 RAB25P57735 213 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 ISL1P61371 349 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 SLC35B1P78383 322 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 DRAM1Q8N682 238 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 ZNF565Q8N9K5 539 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-214ENST00000548849 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms