RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 DLL4Q9NR61 685 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 A6NLC8 198 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TRDCB7Z8K6 153 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 IFNL4K9M1U5 179 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 HS3ST1O14792 307 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SNAPC5O75971 98 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 OR2H2O95918 312 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ADH4P08319 380 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZNF44P15621 663 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 GLRA1P23415 457 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 GATA4P43694 442 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 RAP2BP61225 183 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PPP1R1AQ13522 171 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LY6DQ14210 128 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 VHLLQ6RSH7 139 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SLC22A25Q6T423 547 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 NEK7Q8TDX7 302 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MITD1Q8WV92 249 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 RDH5Q92781 318 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ERGIC1Q969X5 290 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TMEM230Q96A57 120 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LRRC46Q96FV0 321 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 DIRC2Q96SL1 478 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SYT3Q9BQG1 590 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CA10Q9NS85 328 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 AKAP13Q12802 2813 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ABCD4O14678 606 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SLC22A5O76082 557 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SFT2D2O95562 160 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 HAND1O96004 215 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LHBP01229 141 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 AKR1C4P17516 323 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CD34P28906 385 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 FCGR2CP31995 323 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 GLP1RP43220 463 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 KCNJ3P48549 501 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZNF81P51508 661 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 IL13RA1P78552 427 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 BSPH1Q075Z2 132 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LRRC29Q8WV35 223 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LIME1Q9H400 295 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TMEM165Q9HC07 324 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 IL19Q9UHD0 177 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SRRM5B3KS81 715 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 C3orf80F5H4A9 247 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SMLR1H3BR10 107 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SIRPB1O00241 398 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 WNT9BO14905 357 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SPRY3O43610 288 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 RGS11O94810 467 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 IGHV1-46P01743 117 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CD55P08174 381 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SCTP09683 121 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 OR4A8P0C604 315 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZNF728P0DKX0 622 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PGAM2P15259 253 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TNFSF4P23510 183 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SORDQ00796 357 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ADIPOQQ15848 244 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms