RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	ALX3	O95076	343 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	CST2	P09228	141 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	BCL3	P20749	454 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	LAMB1	P07942	1786 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	GPR137	Q96N19	417 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	GPA33	Q99795	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATE1-208	ENST00000540606	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.65	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606		B4E171	279 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TSPAN7	P41732	249 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606		A0A1W2PPE3	182 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV1D-16	P01601	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	CD82	P27701	267 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF488	Q96MN9	340 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	HSBP1	O75506	76 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	PRSS23	O95084	383 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	REG1B	P48304	166 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	OR4S2	Q8NH73	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GAL	P22466	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	DYRK2	Q92630	601 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	CST4	P01036	141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GYPA	P02724	150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	MED30	Q96HR3	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606		K7ESF4	209 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	MPC2	O95563	127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	BGLAP	P02818	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	LGALS7	P47929	136 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GUK1	Q16774	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	FAM219A	Q8IW50	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606		J3KRW8	73 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606		J3QT63	122 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	PRF1	P14222	555 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	NAAA	Q02083	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	AES	Q08117	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	R3HDM4	Q96D70	268 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GFRA3	O60609	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	FOSL1	P15407	271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GZMH	P20718	246 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	BMI1	P35226	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	PMEL	P40967	661 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	GAPT	Q8N292	157 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	IL11	P20809	199 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	UCN	P55089	124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATE1-208	ENST00000540606	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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