RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.55□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 A0A1W2PRF3 423 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 A0A1W2PRM7 423 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 TNFRSF1AP19438 455 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 MPV17P39210 176 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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