RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	GABRR1	P24046	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	POU3F4	P49335	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DYNLT3	P51808	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DLX1	P56177	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DLX6	P56179	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	P2RX3	P56373	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	IL18R1	Q13478	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		Q6ZTK2	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	FGGY	Q96C11	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MAGEB3	O15480	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SULT1B1	O43704	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	INMT	O95050	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZFPL1	O95159	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR2H2	O95918	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ALDOB	P05062	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ARG1	P05089	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CSN2	P05814	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CD2	P06729	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PRKACA	P17612	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RAB3A	P20336	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	BCL3	P20749	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	LMO1	P25800	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DCK	P27707	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	NPBWR2	P48146	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MTNR1B	P49286	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MED21	Q13503	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		Q8N2B8	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	BVES	Q8NE79	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	STMN2	Q93045	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ODAM	A1E959	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SIRPB1	O00241	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	F2RL2	O00254	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DEGS1	O15121	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	BAG2	O95816	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	HCK	P08631	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF44	P15621	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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