RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYRK2Q92630 601 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDSLQ96GA7 329 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYYR1Q96J86 154 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNX22Q96L94 193 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRRQ9GZT4 340 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHST6Q9GZX3 395 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPA2Q9H2U2 334 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF222Q9UK12 451 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SULT1C2O00338 296 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSX5O60225 188 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSPNO60542 156 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CA11O75493 328 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBBP9O75884 186 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TK1P04183 234 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LPLP06858 475 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MELTFP08582 738 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSTT2BP0CG30 244 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAX1P15863 534 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFB7P17568 137 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR3A1P47881 315 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AESQ08117 197 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EDDM3AQ14507 147 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAK1Q16611 211 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC107Q8WV48 283 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST8SIA4Q92187 359 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM168AQ92567 244 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BORCS5Q969J3 196 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAFA1Q96PS6 74 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC32Q9BV29 185 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSX2Q9BZM3 304 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFT46Q9NQC8 304 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MIOXQ9UGB7 285 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CADP27708 2225 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GW55 424 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FUOMA2VDF0 154 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H7C1Q1 480 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 K7N7A8 449 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MGST3O14880 152 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIGLEC5O15389 551 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LANCL1O43813 399 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ORC5O43913 435 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF737O75373 536 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FSTL3O95633 263 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT-ND4P03905 459 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSF3P09919 207 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL7P13232 177 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SELLP14151 372 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMY2BP19961 511 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CBX5P45973 191 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNJ3P48549 501 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EDDM3BP56851 147 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DSCR9P59020 149 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.09□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPICQ8N5J4 248 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms