RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 SSNA1O43805 119 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 PPP3CBP16298 524 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 MPPED2Q15777 294 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF626Q68DY1 528 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 Q6ZPA2 131 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 NUP37Q8NFH4 326 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 OR52B4Q8NGK2 314 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 TERB2Q8NHR7 220 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 CHRNB4P30926 498 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 TSPAN5P62079 268 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF826PQ6ZT77 177 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 OR2Z1Q8NG97 314 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ING3Q9NXR8 418 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 EHFQ9NZC4 300 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 PCP4L1A6NKN8 68 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 TMED4Q7Z7H5 227 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ZDHHC22Q8N966 263 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 POC1AQ8NBT0 407 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 PPA2Q9H2U2 334 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 SPACA1Q9HBV2 294 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ABCD4O14678 606 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 NXPH2O95156 264 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 SULT1A3P0DMM9 295 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 SULT1A4P0DMN0 295 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 CXCL3P19876 107 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 BSPH1Q075Z2 132 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 Q6P435 159 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 SUMF2Q8NBJ7 301 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF69Q9UC07 566 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 TRAV24A0A0B4J272 114 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 MCRIP1C9JLW8 97 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 S100A6P06703 90 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ADORA2A-AS1P86434 159 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 HES4Q9HCC6 221 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ITPR1Q14643 2758 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 HSPB6O14558 160 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 GMFBP60983 142 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 MZT1Q08AG7 82 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 WDR82Q6UXN9 313 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 C17orf107Q6ZR85 190 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 LHFPL1Q86WI0 220 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM17Q86X19 198 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC107Q8WV48 283 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 UFSP2Q9NUQ7 469 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 A6NLC8 198 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 HS3ST1O14792 307 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 GRK1Q15835 563 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 CA10Q9NS85 328 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 COQ3Q9NZJ6 369 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 FAM90A27PA6NNH2 459 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 DEGS1O15121 323 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 NAPSAO96009 420 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 OR4E1P0C645 316 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 CD200P41217 278 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 C4orf46Q504U0 113 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF600Q6ZNG1 722 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 MARCH1Q8TCQ1 289 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 TAAR3PQ9P1P4 343 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 PLSCR5A0PG75 271 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 GLAP06280 429 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 GZMKP49863 264 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 SELENOVP59797 346 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF146Q15072 292 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 AADACL3Q5VUY0 350 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 SLC22A25Q6T423 547 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 NEK7Q8TDX7 302 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 RDH5Q92781 318 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-212ENST00000498678 SLC25A42Q86VD7 318 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF286AQ9HBT8 521 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 WNT9BO14905 357 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF44P15621 663 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 NPY4RP50391 375 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 ELMOD3Q96FG2 381 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 WDR13Q9H1Z4 485 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF222Q9UK12 451 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 PKD1L2Q7Z442 2459 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 NKX2-6A6NCS4 301 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 OR2H2O95918 312 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 SPIN3Q5JUX0 258 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM65Q6PI78 240 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 NGBQ9NPG2 151 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 GPR132Q9UNW8 380 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 IGSF11Q5DX21 431 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms