RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 H2BFSP57053 126 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC26A5P58743 744 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACTC1P68032 377 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACTA1P68133 377 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 FGL1Q08830 312 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 GGTLC2Q14390 218 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TP53I3Q53FA7 332 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 HES5Q5TA89 166 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR2T27Q8NH04 317 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR4K13Q8NH42 304 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR148Q8TDV2 347 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ASB13Q8WXK3 278 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMIM19Q96E16 107 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 PELI1Q96FA3 418 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARL6Q9H0F7 186 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1orf198Q9H425 327 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 MED11Q9P086 117 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 OPN4Q9UHM6 478 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 V9GY05 133 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIEZO1Q92508 2521 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRP4O75096 1905 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A0D9SG52 128 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GW55 424 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB19A4D1S5 217 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 VSTM2BA6NLU5 285 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF879B4DU55 563 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 C11orf98E9PRG8 122 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TEX46H3BTG2 121 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 H7C2Y5 167 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 IMPA2O14732 288 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFSF12O43508 249 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSPAN2O60636 221 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBBP9O75884 186 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 MT-ATP6P00846 226 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD8AP01732 235 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 APOC1P02654 83 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 RLN2P04090 185 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGKV3-11P04433 115 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD14P08571 375 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBBP0CG47 229 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLUP10909 449 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC25A4P12235 298 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTHLHP12272 177 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCL4P13236 92 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCN2P20062 427 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDK2P24941 298 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 EDNRAP25101 427 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 AQP2P41181 271 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFSF10P50591 281 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAS2R20P59543 309 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 GMFBP60983 142 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERVK-16P61578 105 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACTA2P62736 377 aa3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms