RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RND1	Q92730	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RGCC	Q9H4X1	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	LGALS8	O00214	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	SHOX	O15266	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	XRCC2	O43543	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	SPDEF	O95238	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CST4	P01036	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF224	P0DH78	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	COX5B	P10606	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNO	P22674	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	OR3A2	P47893	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R31	P59538	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R46	P59540	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB1A	P62820	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXF2	Q12947	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	PPA1	Q15181	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	MDP1	Q86V88	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	STPG2	Q8N412	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	PHB2	Q99623	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0D9SG52	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730		A1L4Q6	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730		I3L521	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL2L11	O43521	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	PDCD6	O75340	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RP2	O75695	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	RHBDL1	O75783	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXB5	P09067	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms