RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491816.1

PARP1-208, Transcript of poly(ADP-ribose) polymerase 1, human

TSL 2

Gene PARP1, Length 416 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARP1-208	ENST00000491816	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PITX2	Q99697	317 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ATF6B	Q99941	703 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	USE1	Q9NZ43	259 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	MUC4	Q99102	2169 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CCL24	O00175	119 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	UBD	O15205	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SELENOF	O60613	162 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CD14	P08571	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	HCK	P08631	526 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SLC2A1	P11166	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PSG2	P11465	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	GLRA1	P23415	457 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR3A4P	P47883	348 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR1E2	P47887	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CRYBA2	P53672	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR12D2	P58182	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SPIB	Q01892	262 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	STX3	Q13277	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	BIRC5	O15392	142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	LY6G6C	O95867	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	RLN1	P04808	185 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SLC6A1	P30531	599 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	GPR4	P46093	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PRKX	P51817	358 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	MTPN	P58546	118 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	FAM3A	P98173	230 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	PRKCD	Q05655	676 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	TXN2	Q99757	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PARP1-208	ENST00000491816	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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