RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	FUT6	P51993	359 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP3R1	P63098	170 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNG3	P63215	75 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8G1	Q15617	311 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOG	Q16653	247 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DGUOK	Q16854	277 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIGY	Q3MUY2	71 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR82	Q6UXN9	313 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSX8	Q7RTT4	187 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDH26	Q8IXH8	852 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF611	Q8N823	705 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	YIPF5	Q969M3	257 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM46B	Q96A09	425 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPSB1	Q96BD6	273 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDFY2	Q96P53	400 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD1	Q96SE0	405 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAL3ST1	Q99999	423 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP27	Q9H306	513 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HES4	Q9HCC6	221 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NGB	Q9NPG2	151 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TREM2	Q9NZC2	230 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA2	Q9UM82	520 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ING4	Q9UNL4	249 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRBA	P50851	2863 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TACC2	O95359	2948 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GW55	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRP5L	A4QPB2	252 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5B21	A6NL26	309 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		J3QT63	122 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OVOL3	O00110	214 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOCS1	O15524	211 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR7A2	O43488	359 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LANCL1	O43813	399 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RP2	O75695	350 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGA5	P0DJD9	388 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL8A2	P25067	703 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFHR2	P36980	270 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ETV6	P41212	452 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBP2	P50120	134 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP1B3	P54709	279 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PROK1	P58294	105 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL8	P80075	99 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL24	Q13007	206 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6P435	159 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNIH2	Q6PI25	160 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC15	Q8N387	334 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGFRL1	Q8N441	504 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PXT1	Q8NFP0	134 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51F2	Q8NH61	342 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	THRSP	Q92748	146 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITFG2	Q969R8	447 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	BORCS8	Q96FH0	119 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2V2	Q96R30	315 aa		5.12	□□□□□ -1.59

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