RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 MSMPQ1L6U9 139 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 POC1AQ8NBT0 407 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP37Q8NFH4 326 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NEK7Q8TDX7 302 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 MSL2Q9HCI7 577 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 DUSP13Q9UII6 198 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NPTNQ9Y639 398 aa8.8□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 A6NLC8 198 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NAPSAO96009 420 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 THBDP07204 575 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF44P15621 663 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 CD200P41217 278 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 GZMKP49863 264 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NPY4RP50391 375 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 SELENOVP59797 346 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 DHRS2Q13268 280 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNJ8Q15842 424 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6P435 159 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 VHLLQ6RSH7 139 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC22A25Q6T423 547 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZS49 121 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 LYG2Q86SG7 212 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 LRP11Q86VZ4 500 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 SYT3Q9BQG1 590 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 HES4Q9HCC6 221 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.79□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 PLSCR5A0PG75 271 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 SMLR1H3BR10 107 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL21O00585 134 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPB6O14558 160 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 HS3ST1O14792 307 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 FABP7O15540 132 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 CLDN1O95832 211 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5H8P0DN80 308 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 PGAM2P15259 253 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB25P24278 435 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 CHRNB4P30926 498 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 GLP1RP43220 463 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 RAP2BP61225 183 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R1AQ13522 171 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF146Q15072 292 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZPA2 131 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR7Q8TB68 274 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 RDH5Q92781 318 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 Q9N2K0 584 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 NGBQ9NPG2 151 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 DLL4Q9NR61 685 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 GLS2Q9UI32 602 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR132Q9UNW8 380 aa8.78□□□□□ -1
GTPBP1-211ENST00000487538 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf170A2RU37 121 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM172BPA6NC97 362 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 DPRXA6NFQ7 191 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5H14A6NHG9 310 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 POM121CA8CG34 1229 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 H7C1Q1 480 aa8.77□□□□□ -1.01
GTPBP1-211ENST00000487538 SIRPB1O00241 398 aa8.77□□□□□ -1.01
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