RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TPBGQ13641 420 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 IL13RA2Q14627 380 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 THRSPQ92748 146 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 PPA2Q9H2U2 334 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ISYNA1Q9NPH2 558 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 LINC00312Q9Y6C7 94 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPE2 198 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PR64 198 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRV1 198 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 TMEM89A2RUT3 159 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 SC5DO75845 299 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 P2RX3P56373 397 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 PIGYQ3MUY2 71 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 LIPKQ5VXJ0 399 aa17.09■□□□□ 0.33
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ACTB-211ENST00000480301 CDH26Q8IXH8 852 aa17.09■□□□□ 0.33
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ACTB-211ENST00000480301 SLC25A28Q96A46 364 aa17.09■□□□□ 0.33
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ACTB-211ENST00000480301 HSMCR30P0CW71 290 aa17.08■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 FAM27D1Q5T7N8 215 aa17.08■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 JAGN1Q8N5M9 183 aa17.08■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 FAM96BQ9Y3D0 163 aa17.08■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PP11 408 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 MEIOCA2RUB1 952 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 IER3P46695 156 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 GLIPR1P48060 266 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 NHLRC3Q5JS37 347 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 C16orf87Q6PH81 154 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM19Q7Z692 300 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 C17orf50Q8WW18 174 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 MGLLQ99685 303 aa17.07■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 Q9H521 79 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF19Q9NS68 423 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ZNF581Q9P0T4 197 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ST3GAL6Q9Y274 331 aa17.07■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 SERPINA2P20848 420 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 COX7A1P24310 79 aa17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 LRRTM1Q86UE6 522 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 OR4D6Q8NGJ1 314 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 SSMEM1Q8WWF3 244 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 CORO2AQ92828 525 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TMEM203Q969S6 136 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ZNRD1Q9P1U0 126 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 TMEM91Q6ZNR0 172 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 NKAIN3Q8N8D7 197 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 CHIAQ9BZP6 476 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 IFT22Q9H7X7 185 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TCF7L1Q9HCS4 588 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ING3Q9NXR8 418 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ODAMA1E959 279 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 MEGF11A6BM72 1044 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 HSPB6O14558 160 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 MMP23AO75900 390 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 GTF2F2P13984 249 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 SRMP19623 302 aa17.04■□□□□ 0.32
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