RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ASCL1P50553 236 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 CLDN18P56856 261 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 NRN1LQ496H8 165 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 MIDNQ504T8 468 aa14.56□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.56□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.55□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 C1QL1O75973 258 aa14.54□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 TK1P04183 234 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 TSC22D1Q15714 1073 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 C3AR1Q16581 482 aa14.54□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 SEC11BP0C7V7 166 aa14.54□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ARV1Q9H2C2 271 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 OR51B6Q9H340 312 aa14.54□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.54□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.53□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 Q8NFD4 153 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ABI3Q9P2A4 366 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.52□□□□□ -0.08
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