RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 M0R1W7 72 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DLGAP1O14490 977 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DVL1O14640 695 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ADAM20O43506 726 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 NDUFB3O43676 98 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PRKYO43930 277 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CIB2O75838 187 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DHRS3O75911 302 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR2T7P0C7T2 308 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MMP9P14780 707 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CCL1P22362 96 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ANOS1P23352 680 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ACKR3P25106 362 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 HTR1FP30939 366 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ACTC1P68032 377 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ACTA1P68133 377 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ACSM1Q08AH1 577 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PRDX4Q13162 271 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CDONQ4KMG0 1287 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 TMEM42Q69YG0 159 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 STUMQ69YW2 141 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 WDR86Q86TI4 376 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ZNF573Q86YE8 665 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR2T27Q8NH04 317 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 LRRC29Q8WV35 223 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SDSLQ96GA7 329 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 RNF170Q96K19 258 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 LYZL4Q96KX0 146 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 WDFY2Q96P53 400 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR4F4Q96R69 305 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 OR51I2Q9H344 312 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 USE1Q9NZ43 259 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CTSZQ9UBR2 303 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 SNX5Q9Y5X3 404 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 R4GMQ9 66 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 V9GYS6 101 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-204ENST00000461018 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 A0A1W2PPH5 198 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 DPPA5A6NC42 116 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 OR2AT4A6NND4 320 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 H0YHG0 523 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 J3QT63 122 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 CDIPTO14735 213 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 SIGLEC5O15389 551 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 MPZL2O60487 215 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 NRASP01111 189 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 IGHV1-69P01742 117 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 GYPAP02724 150 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 RBP4P02753 201 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 TTRP02766 147 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 ISG15P05161 165 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 KRT8P05787 483 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 MPZP25189 248 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 PAX6P26367 422 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 DLX1P56177 255 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 CDC42P60953 191 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 CXCR4P61073 352 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 ISL1P61371 349 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-204ENST00000461018 CSNK2BP67870 215 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms