RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.11■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 SLC35B3Q9H1N7 401 aa16.11■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 NELFAQ9H3P2 528 aa16.11■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 DNPH1O43598 174 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 ZNF708P17019 499 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 MSR1P21757 451 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 NPY4RP50391 375 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 SPCS3P61009 180 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 PKIAP61925 76 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 QRFPP83859 136 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 SSX2Q16385 188 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 OR2A2Q6IF42 318 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 UBAC2Q8NBM4 344 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 MAFIPQ8WZ33 124 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 K7EPK0 472 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 CYTIPO60759 359 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 BPNT1O95861 308 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 ISG15P05161 165 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 DANCRP0C864 163 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 B4GALT1P15291 398 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 FPR2P25090 351 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 DDTP30046 118 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 FCGR2CP31995 323 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 PRSS12P56730 875 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 AAED1Q7RTV5 226 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 FGGYQ96C11 551 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 GALNT14Q96FL9 552 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 ARV1Q9H2C2 271 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 BCO1Q9HAY6 547 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 HSD11B1P28845 292 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 CYYR1Q96J86 154 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 MED12LQ86YW9 2145 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 CXorf65A6NEN9 183 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 H7C1Q1 480 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 SLC10A1Q14973 349 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 C9orf135Q5VTT2 229 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 FAM57BQ71RH2 274 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 FAM219AQ8IW50 185 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 MUCL1Q96DR8 90 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 LUZP4Q9P127 313 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 SPRR3Q9UBC9 169 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 SVILO95425 2214 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX11-201ENST00000359238 F5H5K5 113 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 SEC11BP0C7V7 166 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 TMEM33P57088 247 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 CLINT1Q14677 625 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 SPACA5Q96QH8 159 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 SSX3Q99909 188 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 C2orf88Q9BSF0 95 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 PBDC1Q9BVG4 233 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 CACNA1GO43497 2377 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 VSIG8P0DPA2 414 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 LMO1P25800 156 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 ZNF616Q08AN1 781 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 TSPO2Q5TGU0 170 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 LYZL4Q96KX0 146 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 ACACAQ13085 2346 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 TSTD3H0UI37 97 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 CHATP28329 748 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 RSU1Q15404 277 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 GPR84Q9NQS5 396 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 FBLN5Q9UBX5 448 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 A0A087X0M5 115 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 A0A1B0GW64 132 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 A0A1B0GX30 115 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 SYT7O43581 403 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 CEACAM4O75871 244 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 SFTPBP07988 381 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 PI3P19957 117 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 RAB4BP61018 213 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 GAMTQ14353 236 aa16.06■□□□□ 0.16
SNX11-201ENST00000359238 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms