RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 C9JQL5 133 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYBA1P05813 215 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CCL2P13500 99 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 F2RL1P55085 397 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A25Q6T423 547 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHA2Q9HB19 425 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MBPP02686 304 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 EDN3P14138 238 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZPA2 131 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PIP4P1Q86T03 277 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RXFP4Q8TDU9 374 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SPSB4Q96A44 273 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM173AQ9BQD7 235 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 BIN3Q9NQY0 253 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF587BE7ETH6 402 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCD6O75340 191 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MEOX1P50221 254 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FXYD4P59646 89 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPO2Q5TGU0 170 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PLCXD3Q63HM9 321 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 BATF2Q8N1L9 274 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGCQ92535 297 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC2A9Q9NRM0 540 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 H7C1Q1 480 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 UCP3P55916 312 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM11P57052 281 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 AVPI1Q5T686 147 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LYZL2Q7Z4W2 148 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 UBAC2Q8NBM4 344 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 C18orf12Q96KH6 178 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TECTBQ96PL2 329 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ARV1Q9H2C2 271 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF286AQ9HBT8 521 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 XRCC2O43543 280 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MOB3AQ96BX8 217 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 E5RGE8 158 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SCGB1D2O95969 90 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNOP22674 350 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CD80P33681 288 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL35P42766 123 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LHX2P50458 406 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ARG2P78540 354 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MALLQ13021 153 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PHLDA2Q53GA4 152 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZRG5 221 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CALHM1Q8IU99 346 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ERGIC1Q969X5 290 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 NSG2Q9Y328 171 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 COLCA2A8K830 154 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 AGPAT2O15120 278 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PMELP40967 661 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ID4P47928 161 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCD1Q15116 288 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PEA15Q15121 130 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM211Q6ICI0 200 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS33Q8NF86 280 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM45BQ96B21 275 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 KIRREL1Q96J84 757 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDM14Q9GZV8 571 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 COA4Q9NYJ1 87 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 BSNQ9UPA5 3926 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SPP1P10451 314 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 AKR1D1P51857 326 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 COLCA1Q6ZS62 124 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf49Q9H741 205 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 STARD10Q9Y365 291 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8U9P0C7N5 309 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FUT3P21217 361 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 NRN1LQ496H8 165 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8U1Q8NH10 309 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SPTA1P02549 2419 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SP1P08047 785 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN18P56856 261 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5L1Q8NGL2 311 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 POM121Q96HA1 1249 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SYT3Q9BQG1 590 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 RSRP1Q9BUV0 290 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC7A10Q9NS82 523 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 CACFD1Q9UGQ2 172 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 NBASA2RRP1 2371 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms