RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SIKE1-201ENST00000060969 WDR86Q86TI4 376 aa15.9■□□□□ 0.14
SIKE1-201ENST00000060969 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.9■□□□□ 0.14
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM230Q96A57 120 aa15.9■□□□□ 0.14
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.9■□□□□ 0.14
SIKE1-201ENST00000060969 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.9■□□□□ 0.14
SIKE1-201ENST00000060969 GPR132Q9UNW8 380 aa15.9■□□□□ 0.14
SIKE1-201ENST00000060969 DBX1A6NMT0 343 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 FUT3P21217 361 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 BEX5Q5H9J7 111 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ELP2Q6IA86 826 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 Q8NA96 180 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 BOD1Q96IK1 185 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 MICU1Q9BPX6 476 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 OR5B21A6NL26 309 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 J3QW42 95 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 HSPB6O14558 160 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ALKBH2Q6NS38 261 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 MKXQ8IYA7 352 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 LIME1Q9H400 295 aa15.89■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 C5orf51A6NDU8 294 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 K7ENP7 123 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 PRKACAP17612 351 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 DTYMKP23919 212 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 PSMB6P28072 239 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 P2RY6Q15077 328 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM17Q86X19 198 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ARPC5LQ9BPX5 153 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 OR51I2Q9H344 312 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 PRR13Q9NZ81 148 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 MBD2Q9UBB5 411 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 FZR1Q9UM11 496 aa15.88■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 OR5H1A6NKK0 313 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 CRHP06850 196 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SELEP16581 610 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 GLRA1P23415 457 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 FPR2P25090 351 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 PTGER4P35408 488 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF273Q14593 569 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF573Q86YE8 665 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 NMES1Q9C002 83 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ZZEF1O43149 2961 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 H0YL77 283 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 RAC2P15153 192 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SERPINF1P36955 418 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 BEND4Q6ZU67 534 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SCGB3A2Q96PL1 93 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 EDARQ9UNE0 448 aa15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM77I1YAP6 450 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 IGLV1-44P01699 117 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 OR5H8P0DN80 308 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SLC22A25Q6T423 547 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 RRP8O43159 456 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 APOC3P02656 99 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TDGF1P3P51864 188 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SLC25A15Q9Y619 301 aa15.86■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.85■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.85■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 A0A0B4J2A0 478 aa15.85■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.85■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 TIMP3P35625 211 aa15.85■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SIKE1-201ENST00000060969 IL24Q13007 206 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms