RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGCQ92535 297 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL17Q92583 94 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 RFT1Q96AA3 541 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMD4Q96H15 378 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 DUX5Q96PT3 197 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 GAL3ST1Q99999 423 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CST11Q9H112 138 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF69Q9UC07 566 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRY3O43610 288 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PRTN3P24158 256 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 FPR2P25090 351 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R20P59543 309 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ZP1P60852 638 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA46Q5T0L3 261 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MOB3CQ70IA8 216 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.13■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa20.13■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SULT1C2O00338 296 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 OR3A4PP47883 348 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G7Q13093 441 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM16LQ309B1 348 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM63Q969Q1 353 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM46BQ96A09 425 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG5Q9H1Y0 275 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 POFUT1Q9H488 388 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 IL36GQ9NZH8 169 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D24Q9ULP9 559 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC2LH3BP13 241 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 UNC119Q13432 240 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CMBLQ96DG6 245 aa20.11■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 S100A13Q99584 98 aa20.11■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 RNF144BQ7Z419 303 aa20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A40Q8TBP6 338 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G10O15496 165 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MELTFP08582 738 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 KITLGP21583 273 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A4Q9H015 551 aa20.09■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 ARL6IP1Q15041 203 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF718Q3SXZ3 478 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-216ENST00000628306 AUNIPQ9H7T9 357 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ING4Q9UNL4 249 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV18A0A075B6X5 111 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 AKR7A2O43488 359 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXH1O75593 365 aa20.08■□□□□ 0.8
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