RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591376.5

CIRBP-232, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 830 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-232ENST00000591376 IL18R1Q13478 541 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 Q6ZS46 218 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 RFT1Q96AA3 541 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 SPSB1Q96BD6 273 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 R3HDM4Q96D70 268 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 RNFT2Q96EX2 444 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR4F4Q96R69 305 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 MBOAT4Q96T53 435 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 HMG20AQ9NP66 347 aa14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 FUOMA2VDF0 154 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 MMP23AO75900 390 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR2H2O95918 312 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 ISG15P05161 165 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR52W1Q6IF63 320 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 HHLA2Q9UM44 414 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.73□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 SLC16A6O15403 523 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 FDX2Q6P4F2 183 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 REC114Q7Z4M0 266 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 SPACA5Q96QH8 159 aa14.72□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 J3QLW9 94 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 J3QRE1 110 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 KDM4BO94953 1096 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 IGKV1D-12P01611 117 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF19P17023 458 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 BRS3P32247 399 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 CCR9P51686 369 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 FBLN7Q53RD9 439 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF596Q8TC21 504 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 STMN2Q93045 179 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 NEK6Q9HC98 313 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 DPM3Q9P2X0 92 aa14.71□□□□□ -0.05
CIRBP-232ENST00000591376 FAM172BPA6NC97 362 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 SNTNA6NMZ2 147 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ALPLP05186 524 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF44P15621 663 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 CDK2P24941 298 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 GLIPR1P48060 266 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ARHGDIBP52566 201 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 SCN1BQ07699 218 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 AESQ08117 197 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 C4orf36Q96KX1 117 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.7□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 EI24O14681 340 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 MT-ND2P03891 347 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 CD24P25063 80 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 LMO1P25800 156 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 BDH1Q02338 343 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 RNF144BQ7Z419 303 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 SGCDQ92629 289 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 CORO2AQ92828 525 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 PELI1Q96FA3 418 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 RHOFQ9HBH0 211 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 ING3Q9NXR8 418 aa14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 A0A1W2PRX2 142 aa14.68□□□□□ -0.06
CIRBP-232ENST00000591376 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms