RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590619.1

DNMT1-222, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 1 (best)

Gene DNMT1, Length 231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-222	ENST00000590619	RAB7A	P51149	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	P2RX3	P56373	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CD81	P60033	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	RAB40B	Q12829	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	AGK	Q53H12	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	AMELY	Q99218	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	MGST3	O14880	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	IDH3B	O43837	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	SOX15	O60248	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	NDUFB8	O95169	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	HAND1	O96004	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	NRAS	P01111	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	IFNA14	P01570	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CSN3	P07498	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CGB3	P0DN86	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CGB7	P0DN87	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	NFYB	P25208	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	DUSP1	P28562	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	FMO3	P31513	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	OPRL1	P41146	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	STX1B	P61266	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619		Q8N402	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	RHOV	Q96L33	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619		U3KQV3	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNMT1-222	ENST00000590619	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	INMT	O95050	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	MOS	P00540	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC6A6	P31641	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	OR3A1	P47881	315 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	NPBWR2	P48146	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	REG1B	P48304	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	AES	Q08117	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	IL24	Q13007	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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