RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS2R20P59543 309 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FGF12P61328 243 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 COL10A1Q03692 680 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HFEQ30201 348 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PCGF3Q3KNV8 242 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6P435 159 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MZT2AQ6P582 158 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZPA2 131 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH26Q8IXH8 852 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 UBALD1Q8TB05 177 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DIRAS2Q96HU8 199 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LURAP1Q96LR2 239 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GAFA1Q96PS6 74 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DIRC2Q96SL1 478 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PECRQ9BY49 303 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPA2Q9H2U2 334 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HES4Q9HCC6 221 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NLKQ9UBE8 527 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB22AQ9UL26 194 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NPTNQ9Y639 398 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 V9GYH0 126 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ROS1P08922 2347 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM235A6NFC5 223 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OOEPA6NGQ2 149 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2AT4A6NND4 320 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN25C9JDP6 229 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 LGALS8O00214 317 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DEGS1O15121 323 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM20O43506 726 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SSX5O60225 188 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 GOSR1O95249 250 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV2-70P01814 119 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 UBBP0CG47 229 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IL2RGP31785 369 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDX2P32119 198 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPZA1P52907 286 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DLX1P56177 255 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MZT1Q08AG7 82 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 EDDM3AQ14507 147 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF79Q15937 498 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CDNFQ49AH0 187 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 STUMQ69YW2 141 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ELP2Q6IA86 826 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB12Q6IQ22 244 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM131AQ6UXB0 335 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC190Q86UF4 302 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD4AQ8N468 514 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM185AQ8NFB2 350 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8TCH9 128 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 NEK7Q8TDX7 302 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC107Q8WV48 283 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 AP3S1Q92572 193 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD1Q96SE0 405 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TM2D1Q9BX74 207 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms