RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZK1IP1Q13113 114 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF546Q86UE3 836 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10K1Q8NGX5 313 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13G1Q8NGZ3 307 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf66Q9H5L9 145 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFSF18Q9UNG2 199 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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CAPNS1-204ENST00000587718 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHATP28329 748 aa21.82■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 MALLQ13021 153 aa21.82■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 FNDC9Q8TBE3 224 aa21.82■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 CALHM2Q9HA72 323 aa21.82■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLCXD3Q63HM9 321 aa21.81■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA10Q9UJ72 324 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC168Q8NDH2 2452 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GW55 424 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 DUX4L2P0CJ85 424 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 DUX4L3P0CJ86 424 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 DUX4L4P0CJ87 422 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 DUX4L5P0CJ88 424 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 DUX4L6P0CJ89 424 aa21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 P2RX3P56373 397 aa21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 DUX4Q9UBX2 424 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 GABRR1P24046 479 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 ELP2Q6IA86 826 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf201Q7Z4U5 140 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 PHYHIPLQ96FC7 376 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 CRHP06850 196 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 COMMD7Q86VX2 200 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 PSMB6P28072 239 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 ARPC4P59998 168 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 PIGCQ92535 297 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 POM121L2Q96KW2 1035 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa21.77■■□□□ 1.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPTL7O43827 346 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 LYL1P12980 280 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZS49 121 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC36Q8IYA8 594 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A32Q9H2D1 315 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 AK3Q9UIJ7 227 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa21.76■■□□□ 1.07
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