RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 HMG20AQ9NP66 347 aa13.43□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TAS2R3Q9NYW6 316 aa13.43□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.43□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MEGF11A6BM72 1044 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 A6NDX4 124 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 XPNPEP2O43895 674 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 FBXO24O75426 580 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ALX3O95076 343 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 IGHA1P01876 353 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OPN1MWP04001 364 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC159P0C7I6 412 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OPN1MW2P0DN77 364 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF44P15621 663 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CEACAM3P40198 252 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GALEQ14376 348 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 Q8N2B8 174 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PIFOQ8TCI5 191 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 STMN2Q93045 179 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 C4orf36Q96KX1 117 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.42□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 A0A0G2JK05 382 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM212A6NML5 194 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 J3QRE1 110 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TOR1AO14656 332 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CHST1O43916 411 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PSPNO60542 156 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 KDM4BO94953 1096 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HCKP08631 526 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NPBWR2P48146 333 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RAB40BQ12829 278 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR4F17Q8NGA8 305 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR52N4Q8NGI2 321 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR4D6Q8NGJ1 314 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR4F4Q96R69 305 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ALG8Q9BVK2 526 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DPM3Q9P2X0 92 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.41□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 LEUTXA8MZ59 168 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SIRPB1O00241 398 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR2H2O95918 312 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CSN2P05814 226 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 LMO1P25800 156 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PAX6P26367 422 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DUSP1P28562 367 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RAB13P51153 203 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PRRX1P54821 245 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SNU13P55769 128 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 KLHL22Q53GT1 634 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HEPN1Q6WQI6 88 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CBR4Q8N4T8 237 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TPRX1Q8N7U7 411 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF565Q8N9K5 539 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CORO2AQ92828 525 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 LGALS12Q96DT0 336 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PELI1Q96FA3 418 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF702PQ9H963 129 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR6C3Q9NZP0 311 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DHDHQ9UQ10 334 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NOTCH1P46531 2555 aa13.4□□□□□ -0.26
SPNS1-211ENST00000568829 VWFP04275 2813 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 OR4C45A6NMZ5 311 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 DEGS1O15121 323 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 SULT1B1O43704 296 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 CD2P06729 351 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM225BP0DP42 221 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 PTGFRP43088 359 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 OR3A1P47881 315 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 BDH1Q02338 343 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 SCN1BQ07699 218 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM219Q86XT9 240 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.39□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 CDK2P24941 298 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 MNDAP41218 407 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 MTNR1BP49286 362 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 KISS1Q15726 138 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 KRBOX4Q5JUW0 171 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 TCF23Q7RTU1 214 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 REC114Q7Z4M0 266 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 LHFPL3Q86UP9 236 aa13.38□□□□□ -0.27
SPNS1-211ENST00000568829 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.4 ms