RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRP3O75074 770 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHG3P01860 377 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CA6P23280 308 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTGER4P35408 488 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 GMFBP60983 142 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLP2Q04941 152 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PHB2Q99623 299 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 C5orf51A6NDU8 294 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 DBX1A6NMT0 343 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RHBDL1O75783 438 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPA2P15927 270 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 APLNRP35414 380 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 MALLQ13021 153 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 BTN1A1Q13410 526 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM189A2Q15884 450 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC22A25Q6T423 547 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PXT1Q8NFP0 134 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD8AP01732 235 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5H8P0DN80 308 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX5BP10606 129 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PGAM2P15259 253 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FPR2P25090 351 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAS2R46P59540 309 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACTBL2Q562R1 376 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELP2Q6IA86 826 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 STX12Q86Y82 276 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ST8SIA2Q92186 375 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TOMM40LQ969M1 308 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10C1Q96KK4 312 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 MBD2Q9UBB5 411 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZZEF1O43149 2961 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB19A4D1S5 217 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SFT2D2O95562 160 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 C4BPBP20851 252 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FXYD4P59646 89 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM17Q86X19 198 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 GP6Q9HCN6 339 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL36GQ9NZH8 169 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSF4Q9ULV5 492 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TSPAN4O14817 238 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDCD6O75340 191 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SP6Q3SY56 376 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR86Q86TI4 376 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPHA2Q96T91 129 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF175Q9Y473 711 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 APC2O95996 2303 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 H0YIZ8 118 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CST4P01036 141 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HOXB5P09067 269 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKR1C2P52895 323 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKR1C1Q04828 323 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 GUSBP1Q15486 140 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 GABRA6Q16445 453 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 DKK4Q9UBT3 224 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIM77I1YAP6 450 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CA11O75493 328 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEACAM1P13688 526 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HLA-GP17693 338 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CALCRP30988 508 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 MARVELD3Q96A59 401 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms