RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A0U1RQV5	110 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A1B0GVI7	797 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639		J3QRE1	110 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	KCNAB3	O43448	404 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC25A17	O43808	307 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	IGHV2-70	P01814	119 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CD55	P08174	381 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ACSM4	P0C7M7	580 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OCM2	P0CE71	109 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PRKX	P51817	358 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	BTG1	P62324	171 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	GNB2	P62879	340 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ACSM1	Q08AH1	577 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TP53I3	Q53FA7	332 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2T2	Q6IF00	324 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639		Q6ZR03	302 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PGAP1	Q75T13	922 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	DDB2	Q92466	427 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC25A28	Q96A46	364 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	C10orf35	Q96D05	121 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	HAVCR1	Q96D42	359 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TECTB	Q96PL2	329 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2V2	Q96R30	315 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	IL19	Q9UHD0	177 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	GGT3P	A6NGU5	568 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PPIAL4D	F5H284	164 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639		H0YL77	283 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM178B	H3BS89	294 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MT-ND2	P03891	347 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CRYBA1	P05813	215 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	WNT2	P09544	360 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	LIMS3	P0CW19	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	LIMS4	P0CW20	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	HSMCR30	P0CW71	290 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	IRF2	P14316	349 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OMG	P23515	440 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CD80	P33681	288 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ETV1	P50549	477 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR12D2	P58182	307 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF85	Q03923	595 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ZMYND11	Q15326	602 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PHYHIP	Q92561	330 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SMIM19	Q96E16	107 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PELI1	Q96FA3	418 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	SLITRK2	Q9H156	845 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM165	Q9HC07	324 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM100	Q9NV29	134 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	CKLF	Q9UBR5	152 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	HHLA2	Q9UM44	414 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	COPS3	Q9UNS2	423 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PSMA4-208	ENST00000558639	LRRC30	A6NM36	301 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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